Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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COL4A6Q14031 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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COL4A6Q14031 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL4A6Q14031 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
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COL4A6Q14031 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL4A6Q14031 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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