Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SNTB1Q13884 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SNTB1Q13884 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms