Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUL4BQ13620 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CUL4BQ13620 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CUL4BQ13620 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
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