Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
BFSP2Q13515 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BFSP2Q13515 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
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