Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PICALMQ13492 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PICALMQ13492 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PICALMQ13492 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
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