Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM32Q13049 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM32Q13049 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms