Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ECH1Q13011 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ECH1Q13011 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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