Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
BNIP1Q12981 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
BNIP1Q12981 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms