Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SREBF2Q12772 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SREBF2Q12772 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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