Protein–RNA interactions for Protein: Q12347

HRT3, F-box protein HRT3, yeastyeast

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRT3Q12347 YOR097CYOR097C 528 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SFG1YOR315W 1041 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SPP381YBR152W 876 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 FRM2YCL026C-A 582 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 MYO3YKL129C 3819 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ALG1YBR110W 1350 nt3.5□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YGL132WYGL132W 336 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YGL177WYGL177W 348 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 PEX21YGR239C 867 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 GEP4YHR100C 558 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SOD1YJR104C 465 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 AHP1YLR109W 531 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ERG29YMR134W 714 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 RCE1YMR274C 948 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 IBD2YNL164C 1056 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 MRP2YPR166C 348 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 NAM2YLR382C 2685 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ARO1YDR127W 4767 nt3.49□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SER3YER081W 1410 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 FMP10YER182W 735 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ERJ5YFR041C 888 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 CMC1YKL137W 336 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 MMM1YLL006W 1281 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 PAM18YLR008C 507 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SMD3YLR147C 306 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 RNA1YMR235C 1224 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YOR314WYOR314W 330 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YAR1YPL239W 603 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 LDH1YBR204C 1128 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 RAD54YGL163C 2697 nt3.48□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 NUR1YDL089W 1455 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 DHR2YKL078W 2208 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SEG1YMR086W 2883 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 IOC4YMR044W 1428 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YFL065CYFL065C 309 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 MTR2YKL186C 555 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ERD2YBL040C 660 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YOR114WYOR114W 885 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YBR013CYBR013C 390 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 YOR338WYOR338W 1092 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SCD6YPR129W 1050 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 BMT2YBR141C 1014 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 NGL3YML118W 1518 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 ECM18YDR125C 1362 nt3.47□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 SAD1YFR005C 1347 nt3.46□□□□□ -1.85
HRT3Q12347 THR4YCR053W 1545 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 SWP82YFL049W 1872 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 ALG11YNL048W 1647 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 CBS2YDR197W 1170 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 COG7YGL005C 840 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RIF2YLR453C 1188 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 SPC2YML055W 537 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RRG9YNL213C 645 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RRP36YOR287C 903 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YRM1YOR172W 2361 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YOL019WYOL019W 1656 nt3.46□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 MSN4YKL062W 1893 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RPA135YPR010C 3612 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 HPR1YDR138W 2259 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 SLX8YER116C 825 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 BCD1YHR040W 1101 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 USB1YLR132C 873 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 GCD7YLR291C 1146 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 PML39YML107C 1005 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 CSM3YMR048W 954 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 UFE1YOR075W 1041 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 PNO1YOR145C 825 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RPA43YOR340C 981 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 ARA1YBR149W 1035 nt3.45□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 DTD1YDL219W 453 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YHR180WYHR180W 492 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YJR037WYJR037W 384 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 GPN3YLR243W 819 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 GSP1YLR293C 660 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RAD33YML011C 534 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 INN1YNL152W 1230 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 IPP1YBR011C 864 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RRP7YCL031C 894 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 PKH1YDR490C 2301 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 GPI1YGR216C 1830 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 GPB1YOR371C 2694 nt3.44□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 MIH1YMR036C 1665 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RKM3YBR030W 1659 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 AUS1YOR011W 4185 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 STE6YKL209C 3873 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 BUD5YCR038C 1929 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 BMS1YPL217C 3552 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YCR101CYCR101C 549 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 RDI1YDL135C 609 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 UBC5YDR059C 447 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YFL012WYFL012W 447 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YIL025CYIL025C 375 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 CSI1YMR025W 888 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 FYV6YNL133C 522 nt3.43□□□□□ -1.86
HRT3Q12347 YBL096CYBL096C 309 nt3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.7 ms