Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAQ4

SMAGP, Small cell adhesion glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAGPQ0VAQ4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMAGPQ0VAQ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.8 ms