Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IFFO1Q0D2I5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IFFO1Q0D2I5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms