Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACTN3Q08043 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACTN3Q08043 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms