Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC3A1Q07837 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC3A1Q07837 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms