Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CKAP4Q07065 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CKAP4Q07065 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms