Protein–RNA interactions for Protein: Q05513

PRKCZ, Protein kinase C zeta type, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCZQ05513 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRKCZQ05513 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKCZQ05513 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms