Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSTF1Q05048 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms