Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CFHR1Q03591 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CFHR1Q03591 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms