Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPL6Q02878 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPL6Q02878 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms