Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BNC1Q01954 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BNC1Q01954 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BNC1Q01954 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BNC1Q01954 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BNC1Q01954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BNC1Q01954 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms