Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
XPCQ01831 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XPCQ01831 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
XPCQ01831 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
XPCQ01831 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
XPCQ01831 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
XPCQ01831 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
XPCQ01831 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
XPCQ01831 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
XPCQ01831 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
XPCQ01831 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
XPCQ01831 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
XPCQ01831 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms