Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRCDQ00LT1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRCDQ00LT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms