Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTRA4P83105 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTRA4P83105 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms