Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRB1P82279 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRB1P82279 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRB1P82279 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRB1P82279 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRB1P82279 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRB1P82279 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRB1P82279 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRB1P82279 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRB1P82279 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms