Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IRX3P78415 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IRX3P78415 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IRX3P78415 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IRX3P78415 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IRX3P78415 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX3P78415 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX3P78415 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX3P78415 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX3P78415 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX3P78415 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX3P78415 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX3P78415 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms