Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TPM4P67936 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPM4P67936 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TPM4P67936 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TPM4P67936 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TPM4P67936 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TPM4P67936 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TPM4P67936 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TPM4P67936 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms