Protein–RNA interactions for Protein: P62877

RBX1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBX1P62877 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBX1P62877 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBX1P62877 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBX1P62877 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBX1P62877 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms