Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2MP61081 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms