Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAB10P61026 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAB10P61026 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RAB10P61026 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RAB10P61026 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RAB10P61026 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RAB10P61026 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB10P61026 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB10P61026 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB10P61026 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB10P61026 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RAB10P61026 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RAB10P61026 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms