Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNAP25P60880 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNAP25P60880 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms