Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
AP3S2P59780 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AP3S2P59780 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms