Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RWDD2BP57060 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RWDD2BP57060 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms