Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRPF1P55201 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRPF1P55201 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms