Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
AFDNP55196 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AFDNP55196 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AFDNP55196 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AFDNP55196 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
AFDNP55196 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
AFDNP55196 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
AFDNP55196 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AFDNP55196 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
AFDNP55196 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms