Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MFAP3P55082 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MFAP3P55082 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms