Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLTPP55058 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLTPP55058 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLTPP55058 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLTPP55058 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLTPP55058 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLTPP55058 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLTPP55058 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PLTPP55058 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PLTPP55058 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms