Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AIF1P55008 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AIF1P55008 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AIF1P55008 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
AIF1P55008 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AIF1P55008 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AIF1P55008 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms