Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB3P54753 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms