Protein–RNA interactions for Protein: P53990

IST1, IST1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IST1P53990 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
IST1P53990 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IST1P53990 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IST1P53990 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IST1P53990 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IST1P53990 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IST1P53990 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IST1P53990 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IST1P53990 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IST1P53990 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 789.1 ms