Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF140P52738 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF140P52738 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF140P52738 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF140P52738 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF140P52738 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF140P52738 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms