Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCN3P51790 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN3P51790 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms