Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
SMARCA2P51531 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SMARCA2P51531 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms