Protein–RNA interactions for Protein: P51160

PDE6C, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6CP51160 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDE6CP51160 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDE6CP51160 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms