Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HARS2P49590 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HARS2P49590 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HARS2P49590 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HARS2P49590 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HARS2P49590 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HARS2P49590 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HARS2P49590 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms