Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK8P49336 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK8P49336 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDK8P49336 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDK8P49336 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDK8P49336 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDK8P49336 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms