Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMAN1P49257 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms