Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI2P48788 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI2P48788 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms