Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AMTP48728 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AMTP48728 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
AMTP48728 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
AMTP48728 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
AMTP48728 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms