Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGIRP43119 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PTGIRP43119 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms