Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CASP3P42574 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CASP3P42574 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP3P42574 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP3P42574 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP3P42574 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms